9月12日和多特蒙德的比赛，穆勒再次替补登场，这仅仅是他的第7场德甲比赛，而他也终于有所斩获，本场比赛他独中两元，帮助拜仁51横扫对手，不仅打入德甲处子球，还超额完成了任务他也在赛后被媒体评为本场比赛的最佳球星，4天之后，他又在拜仁和海法马卡比的欧冠比赛中再入两球，帮助球队30大胜短短一个月时间。